Mlliyet Milliyet Blog Milliyet Blog
 
Facebook Connect
Blog Kategorileri
 

24 Temmuz '11

 
Kategori
Bilim
Okunma Sayısı
1613
 

Canlılarda Sitokrom-C birliği ve benzerliği

Sitokrom-C, canlılık için gerekli olan bir enzimdir. Hücre içinde solunum işlevinin bir parçası olan mitokondrilerde oksijeni bir yandan öbür yana taşıma görevi yüklenmiştir. Enzimler, bir tepkimeyi, canlılığın bütünlüğünü bozmadan, düşük sıcaklıklarda en hızlı şekilde gerçekleştirmek için canlıların işletim sistemi için evrimleşmiş, çoğunlukla orta büyüklükte moleküllerdir. Böyle bir molekülün evrimsel geçmişini ve canlıların akrabalık ilişkilerini bilmeden atomlarının ya da molekülü oluşturan alt birimlerinin dizilişindeki olasılığı hesaplamaya kalkışırsak, inanılmaz küçük bir olasılık çıkar ve bunun bir rastlantı sonucu olarak ortaya çıkamayacağını düşünmeye hakkımız vardır. Söz konusu olasılık, canlıların yapı taşları olan 20 farklı amino asidin, 100 taneden oluşan bir tespih şeklinde dizilmesinde, herhangi bir kombinasyonun ortaya çıkma olasılığıdır. Sitokrom-C enziminde 100 aminoasit vardır. Örneğin 1’den 100’e kadar, örnekleme verirsek 1. sırada mavi boncuk, 5. sırada sarı boncuk, 87. sırada kırmızı boncuk ve buna benzer yüzlük bir dizilimin ortaya çıkma olasılığı her zaman 20 üzeri 100‘dür (20’nin yanında 100 tane sıfır mevcut), (buradaki 20 boncuk çeşitleri, 100 de tespihteki boncuk sayısıdır). Böyle bir molekülün birden bire ortaya çıkma olasılığı her zaman budur. 

Yaratışçılar Sitokrom-C’nin kendiliğinden böyle dizilemeyeceği için 20 üzeri 100 olasılıkla birdenbire ortaya çıktığını söylemektedirler. Bu da onlara göre Allah’ın bir hikmetidir. Onlara göre proteinler ve canlılığa ait hiçbir şey indirgenemez. Ama gerçek böyle değildir. Evrim bir şeyin hemen ortaya çıktığını söylemez. Onun aşmalar geçirerek nasıl geliştiğini açıklar. Sitokrom-C seçile seçile insanda bulunan 100 aminoasit taneli durumuna gelmiştir. Her canlı kendine özgü Sitokrom-C taşır ve molekülün benzerliği de türler arasındaki akrabalığın derecesini yansıtır. Yani bu molekül sihirli bir molekül değil, çeşitlenebilir, farklı aminoasit dizilim kombinasyonları çeşitli ortamlarda iş yapabilir. Kısaca Sitokrom-C’nin iş görebilmesi için tek bir dizilim olasılığı yoktur ve birçok farklı dizilim farklı canlılarda aynı işi görmeye devam eder. Sitokrom-C’nin canlılardaki izini sürersek canlılar arasındaki akrabalıkların da ipuçlarını yakalarız.
Sitokrom-C’nin 100 birimlik diziliminde, maymunlarla insanlar arasındaki fark sadece 54’ncü sıradaki aminoasittir. Diğerleri aynıdır. Bir insanın Sitokrom-C’sinin var olan şekilde dizilme ihtimali 20 üzeri 100’dür. Bir maymunda bu molekülün sadece 1 aminoasitinin insanınkinden farklı olması, maymun ile insan molekülü açısından bir rastlantı olarak benzer olma şansının 20 üzeri 99 (1 rakamını, arkasına 99 tane sıfır konmuş 20 rakamına bölerseniz, çıkan sayının olasılığı kadar) olasılıkla maymunla aynı molekülü paylaşmışız demektir. Böyle bir olasılık kural olarak yok demektir (Yaratılışçılar akılları almadığı için aynı olasılığın birdenbire oluşamayacağını o yüzden her şeyin birdenbire yaratıldığını söylerler. Akılları ancak bunu kabul eder. Bilim ise mucizelere gereksinme duymaz). Bu benzer durum ancak aynı kökenden gelmiş isek gerçekleşebilir. Evrimin bir döneminde sadece bir mutasyon ile son aşamada birbirinden ayrılmış, yani ortak atadan evrimleşmişiz demektir. Hayvanlar dünyasında bize genel yapısı ile ne kadar benzerlik gösterenler varsa, benzerlik oranında bu moleküllerde de o kadar benzerlik bulunmaktadır. Köpeklerle insanlar arasında Sitokrom-C diziliminde 15 farklı aminoasit vardır. Bira mayası bize çok uzak akraba olduğu için de 84 aminoasit tanesi farklıdır. Ama hepsi aynı işi görürler. Farklılığın artması ve azalması aradaki akrabalığın derecesini gösterir.
Sitokrom-C proteini, maymunlarla insanların yakın akrabalığını gösteren en önemli kanıtlardan biridir. 20 farklı değişkenin, 100 birimlik diziliminde 99 defa denk gelmesinin akla yakın başka bir açıklaması olamaz. Ama yaratılışçılar bunu ‘Allah böyle yarattı’ şeklinde hiç de bilimsel olmayan bir yolla açıklayabilirler. 

 

 

Sitokrom-C’nin canlılar arası moleküler benzerliği (homoloji) (yalnız farklı olanlar yazılmıştır) 

 

 

10 

11 

12 

13 

14 

15 

16 

17 

18 

19 

20 

21 

22 

İnsan 

 

Gly 

Asp 

Val 

Glu 

Lys 

Gly 

Lys 

Lys 

Ile 

Phe 

Ile 

Met 

Lys 

Cys 

Ser 

Gln 

Cys 

His 

Thr 

Val 

Glu 

Lys 

Domuz 

 

Val 

Gln 

Ala 

Tavuk 

 

Ile 

Val 

Gln 

Köpekbalığı 

 

Val 

Val 

Gln 

Ala 

Asn 

Sinek 

 

Leu 

 

Val 

Gln 

Arg 

 

Ala 

Ala 

Buğday 

 

Asn 

Pro 

Asp 

Ala 

Ala 

Lys 

Thr 

Ala 

Asp 

Ala 

Bira mayası 

 

Ser 

Ala 

Lys 

Ala 

Thr 

Leu 

Lys 

Thr 

Arg 

Glu 

Leu 

20 Aminoasitin üç ve tek harfli kodları 

 

 

Alanine  

Ala  

A  

hyhobic 

Arginine  

Arg  

R  

free amino group makes it basic and hyhilic 

Asparagine  

Asn  

N  

carbohydrate can be covalently linked ("N-linked) to its -NH 

Aspartic acid  

Asp  

D  

free carboxyl group makes it acidic and hyhilic 

Cysteine  

Cys  

C  

oxidation of their sulfhydryl (-SH) groups link 2 Cys (S-S) 

Glutamic acid  

Glu  

E  

free carboxyl group makes it acidic and hyhilic 

Glutamine  

Gln  

Q  

moderately hyhilic 

Glycine  

Gly  

G  

so small it is amphiphilic (can exist in any surroundings) 

Histidine  

His  

H  

basic and hyhilic 

Isoleucine  

Ile  

I  

hyhobic 

Leucine  

Leu  

L  

hyhobic 

Lysine  

Lys  

K  

strongly basic and hyhilic 

Methionine  

Met  

M  

hyhobic 

Phenylalanine  

Phe  

F  

very hyhobic 

Proline  

Pro  

P  

causes kinks in the chain 

Serine  

Ser  

S  

carbohydrate can be covalently linked ("O-linked") to its -OH 

Threonine  

Thr  

T  

carbohydrate can be covalently linked ("O-linked") to its -OH 

Tryptophan  

Trp  

W  

scarce in most plant proteins 

Tyrosine  

Tyr  

Y  

a phosphate or sulfate group can be covalently attached to its -OH 

Valine  

Val  

V  

hyhobic 

 


Kaynak 1: Prof.Dr. Ali Demirsoy 

Kaynak 2: Wikipedia 

 

 

Önerilerine Ekle Beğendiğiniz blogları önerin, herkes okusun.

 
Tıklayın, siz de blog yazarı olun! Aklınızdan geçenleri paylaşın!
 
 

Nedir acaba? Mesela hiç yanılmaz mı? Çoook! Tıpta mesela bugünkü bir bilgi (bir buluş) yarın sabah kalktığınızda altüst olmuş olabiliyor! Mesela anne sütü hakkında bilim (tıp) yıllarca hep zik zaklar çizdi: Kah bir yıl emzirmek yeterli dedi, kah anne sütü yetmez en iyisi mamlardır dedi! Ama Kuran'da bu konuda bir ayet var ki(Bakara, 233) "Anneler çocuklarını tam iki yıl emzirsinler." diyor... Ne zaman demiş bunu? 1400 yıl önce... Eee şimdi dünya sağlık örgütü ne diyor emzirme konusunda? Aynı şeyi söylüyor! Yani Kuran bugünkü gerçeği bundan 1400 yıl önce belirtirken bilim daha yeni bunun farkında!Bakın Kuran'da çocuğun ana rahmine düşüşü anlatılırken bugünkü embriyolojiye uygun terimler kullanılmış daha o zaman! bunu bilim adamları söylüyor! Ayrıca Prof. Ali Demirsoy'u ben tanırım, bizim hocamızdı tıp fakültesinde, kendisi ateisttir... Olabilir, siz bu konuları bir de inan bir bilim adamının kaleminden okuyun derim! Yine de yazmakta, tartışmakta yarar var, elinize sağlık...

Dr Atanur Yıldız 
 28.07.2011 7:04
Cevap :
Bilim elbette yanılır, zigzag çizer, sonra kesinlikle doğruyu bulur. Neden? Çünkü takıntısı yoktur. Hiçbir konuya: "Bu böyledir" diye başlamaz. Kuran'ın 1400 yıl önce bunları yazmış olmasında bir gariplik göremiyorum. Tıp o zaman da vardı. Ali Demirsoy'u tanımış olmanız iyi. Ben tanımıyorum. Dürüst müydü? Size bir ayırım yaptı mı? Teşekkür ederim katkılarınız için. Saygılar sunarım.  28.07.2011 20:18
 

hyhobic denilen yerler, "hyhobic=Su fobisi olan" olması gerekmiyor mu? diğer sorum, Sitokrom-C bir protein olması lazım, elektron taşımada görev alıyor. Enzim dediğiniz, "sitokrom-c oksidaz" olabilir mi?

Ferhat Yıldız 
 25.07.2011 13:18
Cevap :
Merhaba, dediğiniz gibi hyhobic hydrofobik, su fobisi olan, hyhilic de hiydrofilic, su seven olması lazım. Orijinalinde doğru ama nedendir bilinmez burada böyle çıkmış. Enzimler de proteindir. Reaksiyona girmeyen anlamında enzim dedim. Yani hem sizin dediğiniz hem de yazdığım şekliyle doğrudur. Teşekkür ederim, ilgilendiğiniz için. Saygılar.  25.07.2011 14:59
 
Facebook hesabınızla yorum yapın, daha çabuk onaylansın!
 
Toplam blog
: 125
Toplam yorum
: 274
Toplam mesaj
: 43
Ort. okunma sayısı
: 5866
Kayıt tarihi
: 18.11.09
 
 

İstanbul 1980 doğumluyum. Yüksekokul mezunuyum. İstanbul'da oturuyorum. Dünya ve çevre hakkında düşü..

 
 
Yazarı paylaş
  • Tümünü göster